Existe uma maneira de evitar falsos negativos de um processo que varia?

Eu tenho um processo diário que registra a conclusão e um aviso do LogDNA se estiver ausente. No entanto, ele funciona por diferentes períodos de tempo (variando em segundos), então recebo um falso negativo de que não foi executado em dias em que leva mais tempo. Existe uma maneira de evitar isso?