Existe uma boa maneira de configurar um documento PDF contendo hiperlinks antes de fazer o upload?

Antes de fazer o upload no Flipsnack, nossos documentos em PDF são criados através do Adobe InDesign e hiperlinkados por lá primeiro. Notei que o Flipsnack só lê automaticamente os hiperlinks que dizem diretamente ".com" e não palavras que estão hiperlinkadas. Por exemplo, "www.flipsnack.com" vs "Flipsnack" (com a segunda forma sendo hiperlinkada para a URL). Existe uma solução alternativa para obter uma melhor leitura disso? Obrigado!