¿Cuál es la mejor manera de dividir los escaneos para que no utilicen licencias y para que los escaneos no terminen siendo bloqueados?

Recomendaría dividirse en grupos según su organización y ejecutar primero el descubrimiento de hosts y realizar un escaneo basado en activos para evitar esta situación. Por ejemplo, si su empresa tiene dos oficinas, una en EE. UU. y otra en el Reino Unido, y cada ubicación tiene alrededor de 15 V-LANs, también las divide en Servidor, Red y PC (recuerde siempre mantener sus V-LANs segregadas), de esta manera será fácil gestionar las vulnerabilidades y también fácil para la elaboración de informes. Así que, basado en esta segregación, también divide el descubrimiento de hosts, lo cual será más rápido que ejecutar el descubrimiento de hosts de todas las V-LANs. Luego, cree activos según su preferencia (DNS, IP, etc.) y realice un escaneo completo en ellos para evitar problemas de licencias. Además, si tiene un administrador de Nessus y no está utilizando completamente la licencia, úselos en los servidores.